莫斯比人

基于双聚类的分子特征识别


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包是双聚集系综方法MoSBi(来自双聚集的分子签名识别)的实现。MoSBi为双聚类结果提供了标准化接口,并可以将其结果与多算法集成方法相结合,以在分子组学数据上计算稳健的集成双聚类。这是通过计算双聚类的相似网络和使用自定义错误模型过滤重叠来实现的。然后,它使用路文模块化从相似网络中提取出双聚类社区,然后将其转换为集成双聚类。此外,MoSBi还包括几种网络可视化方法,以直观、可扩展地概述结果。MoSBi附带了几个双聚类算法,但可以很容易地扩展到新的双聚类算法。

作者:蒂姆·丹尼尔·罗斯(Tim Daniel Rose)[cre,aut]、乔希·康斯坦丁·鲍林(Josch Konstantin Pauling)[aut]和尼古拉·科勒(Nikolai Koehler)[aut]

维护人员:蒂姆·丹尼尔·罗斯(Tim Daniel Rose)

引文(从R中输入引文(“mosbi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“mosbi”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“mosbi”)
工作流示例 HTML格式 R脚本
相似度量评估 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 群集,网络,软件,统计方法
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(3年)
许可证 AGPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.1)
进口 卢比,伯克希尔哈撒韦,xml语言2、方法、,记录仪,法比亚,Rcpp并行,双集群,国际标准化组织2,QUBIC公司,阿克比克洛斯特,R彩色啤酒
系统要求 C++17,GNU制造
统一资源定位地址
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建议 针织物,rmarkdown公司,生物遗传学,可运行的,仿生风格,测试那个(>= 3.0.0)
链接到 卢比,伯克希尔哈撒韦,Rcpp并行
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 莫斯科_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 mosbi_1.10.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 莫斯科_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 莫斯科_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosbi
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/mosbi
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/mosbi网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/mosbi/
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