集合基因
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生成转基因图的软件包
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包生成元基因图，以比较DNA相互作用蛋白在选定的基因/特征组上的行为。Bam文件用于提高分辨率。一次分析中可以比较一组bam文件和/或一组基因组区域的多重组合。Bootstraping分析用于比较组和定位具有统计差异富集特征的区域。
作者：查尔斯·乔利·博帕兰特（Charles Joly Beauparlant）、法比安·克劳德·拉马泽（Fabien Claude Lamaze）、拉瓦尔·卡巴赫（Fabien.Lamaze.1 at ulaval.ca>）、拉万·桑布（Rawane Samb）、塞德里克·利彭斯（Cedric Lippens）、塞德里克·塞德里克（Cedric Lippens.Cedric at protonmail）、阿斯特里德·路易斯·德塞恩斯（Astrid Louise Deschenes）。Deschenes在crchudequebec.ulaval.ca>和Arnaud Droit<Arnaud.Droit在crchuq.ulaval.ca>。
维护人员：查尔斯·乔利·博帕兰特
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“metagene”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
| 生物视图 |
对齐,ChIPSeq公司,新闻报道,遗传学,多重比较,排序,软件 |
| 版本 |
2.36.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.0（R-3.1）（10年） |
| 许可证 |
Artic-2.0 |文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），R6级(>= 2.0),基因组范围,生物并行 |
| 进口 |
无线电跟踪器,gplots（gplots）、工具、，基因组比对,基因组信息Db,基因组特征,I范围,ggplot2,Rsamtools软件,矩阵统计,呜呜声,数据表,马格里特、方法、实用程序，集成数据库,EnsDb公司。哈皮恩斯v86,字符串 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
| 错误报告 |
https://github.com/CharlesJB/metagene/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
