代谢组学工作台

R中的代谢组学工作台


生物导体版本:释放(3.19)

此包提供了与Metabolomics Workbench RESTful API接口的功能。可以使用API搜索研究、化合物、蛋白质和基因信息。还包括以通用生物导体格式(如SummarizedExperiment和MultiAssayExperiment)获取研究数据的方法。

作者:加文·莱斯·劳埃德[aut,cre],拉尔夫·约翰内斯·玛丽亚·韦伯[aut]

维护人员:加文·莱斯·劳埃德(Gavin Rhys Lloyd)

引文(从R中输入引文(“代谢组学工作台”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“metabolomicsWorkbenchR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“代谢组学工作台”)
使用structToolbox的示例 HTML格式 R脚本
简介_to_metabolomicsWorkbenchR HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 代谢组学,软件
版本 1.14.2
在生物导体中 生物C 3.12(R-4.0)(4年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.0)
进口 数据表,高温气冷堆,jsonlite公司、方法、,多重分析实验,结构,总结性实验,实用程序
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 仿生风格,覆盖(covr),针织物,HDF5阵列,httptest(httptest),rmarkdown公司,structToolbox结构工具箱,测试那个,pmp(pmp),网格,png公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 代谢组学工作台R_1.14.2.tar.gz
Windows二进制 代谢组学工作台R_1.14.2.zip
macOS二进制(x86_64) 代谢组学工作台R_1.14.2.tgz
macOS二进制(arm64) 代谢组学工作台R_1.14.2.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metabolomicsWorkbenchR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/metabolomicsWorkbenchR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档