喜鹊

用于基因组能量调查和评估的MeRIP-Seq数据分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包旨在对MeRIP-seq研究进行功率分析。它计算各种研究设计参数下的FDR、FDC、功率和精度，包括但不限于样本量、测序深度和测试方法。它还可以将结果输出到.xlsx文件或生成相应的选择图形。

作者：段道玉[aut，cre]，郭振兴[aut]

维护人员：段道玉<dxd429 at case.edu>

引文（从R中输入引文（“喜鹊”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“喜鹊”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“喜鹊”）

生物视图	差异甲基化,表转录组学,RNA序列,排序,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3.0）
进口	实用程序，无线电跟踪器,矩阵,矩阵统计，统计，S4载体、方法、图形、，基因组范围,基因组特征,I范围,Rsamtools软件,注释Dbi,声光器件,生物并行,DESeq2公司,开放式xlsx,R彩色啤酒,重塑2,应力
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/dxd429/magpie网站
错误报告	https://github.com/dxd429/magpie/issues网站

建议	针织物,rmarkdown公司,kableExtra（额外）,RUnit（运行单位）,TBX20Bam子集,生物遗传学,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	magpie_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	magpie_1.4.0.zip
macOS二进制（x86_64）	magpie_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）	magpie_1.4.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/magpie网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/喜鹊
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/magpie网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/magpie网站/
软件包下载报告	下载统计信息