位置2路径

基因座2path:基于组织特异性表达QTL的基因组区间调控注释


生物导体版本:释放(3.19)

loci2path对感兴趣的基因组区域中的eQTL进行统计-严格富集分析。使用基因型问题表达(GTEx)项目提供的eQTL集合和MSigDB的通路集合。

作者:徐天雷

维护人员:徐天雷<天雷.Xu at emory.edu>

引文(从R中输入引文(“loci2path”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“loci2path”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“loci2path”)
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新闻 文本

细节

生物视图 BioCarta公司,新闻报道,功能基因组学,基因表达式,GeneSet扩展,遗传学,排序,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0)
进口 情势图,文字云,R彩色啤酒,数据表、方法、grDevices、统计、图形、,基因组范围,生物并行,S4载体
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/StanleyXu/loci2path
错误报告 https://github.com/StanleyXu/loci2path/issues网站
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源程序包 位置2路径_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 位置2路径_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 位置2路径_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) 位置2路径_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/loci2path
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/loci2path/
包短Url https://bioconductor.org/packages/loci2path/
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