等轴测图

从小RNA-seq分析isomiRs和miRNAs


生物导体版本:释放(3.19)

miRNAs和isomiRs的特征、聚类和差异表达。

作者:Lorena Pantano[aut,cre],Georgia Escaramis[aut](CIBERESP-CIBER流行病学和公共服务)

维护人员:洛雷娜·潘塔诺(Lorena Pantano)<Lorena.Pantano at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“isomiRs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“isomiRs”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“isomiRs”)
miRNA和isomiR分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 群集,差异表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,软件,微小RNA
版本 1.32.1
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.4),总结性实验
进口 注释Dbi,生物遗传学,博科生物,扫帚,集群,奶牛场,DEG报告,DESeq2公司,I范围,数字播放器,基因组范围,gplots(gplots),ggplot2,gtools公司,额外网格、网格、gr设备、图形、,GGally公司,利马、方法、,R彩色啤酒,阅读器,重塑,爱尔兰航空公司,统计,字符串,S4载体,第三年,易怒的
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/lpantano/isomiRs/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 isomiRs_1.32.1.tar.gz
Windows二进制 isomiRs_1.32.1.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 异miRs_1.32.1.tgz
macOS二进制(arm64) 异miRs_1.32.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomiRs网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/isomiR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/isomiRs网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/isomiRs/
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