hdxmsqc

氢氘交换质谱实验质量控制的R包


生物导体版本:释放(3.19)

hdxmsqc包使我们能够分析和可视化HDX-MS实验的质量。作为下游分析和发布前的最终质量检查,或作为确定数据质量的互动程序的一部分。该软件包建立在QFeatures和Spectra软件包的基础上,与其他质谱数据集成。

作者:奥利弗·克鲁克

维护人员:奥利弗·克鲁克(Oliver M.Crook)<Oliver.Crook at stats.ox.ac.uk>

引文(从R中输入引文(“hdxmsqc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“hdxmsqc”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“hdxmsqc”)
差分氢氘交换质谱数据的质量控制 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,质量控制,软件
版本 1.0.1
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=4.3),Q功能,S4载体,光谱
进口 dplyr公司,三年,ggplot2,仿生风格,针织物,方法,grDevices,统计,MsCoreUtils(MsCore实用程序)
系统要求
统一资源定位地址 http://github.com/ococrok/hdxmsqc
错误报告 https://github.com/ococrockle/hdxmsqc/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 hdxmsqc_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 hdxmsqc_1.0.1.zip
macOS二进制(x86_64) hdxmsqc_1.0.1.tgz
macOS二进制(arm64) hdxmsqc_1.0.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hdxmsqc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hdxmsqc
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/hdxmsqc/
包短Url https://bioconductor.org/packages/hdxmsqc/
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