石墨
路径拓扑环境中的图形交互
生物导体版本:释放(3.19)
路径拓扑中的图形对象源自KEGG、Panther、PathBank、PharmGKB、Reactome SMPDB和WikiPathways数据库。
作者:Gabriele Sales[cre]、Enrica Calura[aut]、Chiara Romualdi[aut]
维护人员:Gabriele Sales在unipd.it>的销售
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“石墨”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“石墨”)
细节
生物视图 |
图形和网络,KEGG公司,代谢组学,网络,路径,反应途径,软件,第三方客户端 |
版本 |
1.50.0 |
在生物导体中 |
生物C 2.9(R-2.14)(13岁) |
许可证 |
AGPL-3型 |
取决于 |
R(>=4.2),方法 |
进口 |
注释Dbi,图表(>= 1.67.1),高温气冷堆,说唱歌手,stats,utils,图形,爱尔兰航空公司,呜呜声 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/sales-lab/graphite网站 |
错误报告 |
https://github.com/sales-lab/graphite/issues |
查看更多
建议 |
将死,a4预处理,所有,仿生风格,编码工具,hgu133加2.db,hgu95av2.db型,插补,针织物,组织Hs.eg.db,平行,R.rsp公司,RCy3号机组,rmarkdown公司,SPIA公司(>= 2.2),测试那个,拓扑GSA(>= 1.4.0) |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
|
导入我 |
CBN图,dce公司,扩展浏览器,MIRit公司,莫格萨,多GSEA,反应omePA,斯纳普,ICDS系统,netgsa公司 |
建议我 |
剪刀,InterCellar公司,代谢数据映射 |
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。