石墨

路径拓扑环境中的图形交互


生物导体版本:释放(3.19)

路径拓扑中的图形对象源自KEGG、Panther、PathBank、PharmGKB、Reactome SMPDB和WikiPathways数据库。

作者:Gabriele Sales[cre]、Enrica Calura[aut]、Chiara Romualdi[aut]

维护人员:Gabriele Sales在unipd.it>的销售

引文(从R中输入引文(“石墨”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“石墨”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“石墨”)
路径拓扑环境中的图形交互 PDF格式 R脚本
代谢物.pdf PDF格式
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形和网络,KEGG公司,代谢组学,网络,路径,反应途径,软件,第三方客户端
版本 1.50.0
在生物导体中 生物C 2.9(R-2.14)(13岁)
许可证 AGPL-3型
取决于 R(>=4.2),方法
进口 注释Dbi,图表(>= 1.67.1),高温气冷堆,说唱歌手,stats,utils,图形,爱尔兰航空公司,呜呜声
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/sales-lab/graphite网站
错误报告 https://github.com/sales-lab/graphite/issues
查看更多
建议 将死,a4预处理,所有,仿生风格,编码工具,hgu133加2.db,hgu95av2.db型,插补,针织物,组织Hs.eg.db,平行,R.rsp公司,RCy3号机组,rmarkdown公司,SPIA公司(>= 2.2),测试那个,拓扑GSA(>= 1.4.0)
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增强功能
取决于我
导入我 CBN图,dce公司,扩展浏览器,MIRit公司,莫格萨,多GSEA,反应omePA,斯纳普,ICDS系统,netgsa公司
建议我 剪刀,InterCellar公司,代谢数据映射
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 石墨_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 石墨_1.50.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 石墨1.50.0.tgz
macOS二进制(arm64) 石墨1.50.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/石墨
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/graphite网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/graphite网站/
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