流动捕集器

用于分析体内显微镜成像数据的工具，重点是跟踪流动血细胞

生物导体版本：释放（3.19）

flowcatchR是一套用于分析体内显微镜成像数据的工具，专注于追踪流动的血细胞。它指导从分割到计算特征的步骤，过滤掉不感兴趣的粒子，还提供了一组实用程序来帮助检查所执行操作的质量（例如，分割有多好）。它允许研究追踪流动细胞（如血管中的流动细胞）的问题，以对流动、滚动和粘附的颗粒进行分类。这种分类适用于止血和血栓形成等现象的研究。此外，flowcatchR提供了一个集成的工作流解决方案，该解决方案基于与Shiny App和Jupyter笔记本的集成，与软件包一起交付，可以在R环境中实现完全可复制的生物图像分析。

作者：费德里科·马里尼[aut，cre]

维护人员：费德里科·马里尼（Federico Marini）

引文（从R中输入引文（“flowcatchR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“flowcatchR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“flowcatchR”）

flowcatchR：在延时显微镜图像中跟踪和分析细胞	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	细胞生物学,分类,图形用户界面,基础设施,ShinyApps公司,软件,可视化
版本	1.38.0
在生物导体中	生物技术3.0（R-3.1）（10年）
许可证	BSD_3_clause+文件许可证
取决于	R（>=2.10），方法，EB图像
进口	颜色渐变,阿宾德,生物并行，图形，统计，实用程序，巧妙地,闪亮的
系统要求	图像Magick
统一资源定位地址	https://github.com/federicomarini/flowcatchR https://federicomarini.github.io/flowcatchR/
错误报告	https://github.com/federicomarini/flowcatchR/issues网站

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司
链接到
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取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	流量捕捉器R_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	flowcatchR_1.38.0.zip阀
macOS二进制（x86_64）	流量捕捉器R_1.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）	流量捕捉器R_1.38.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowcatchR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/流捕集器
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/flowcatchR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/flowcatchR/
软件包下载报告	下载统计信息