flowSpecs(流量规格)
用于处理高维细胞数据的工具
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包旨在填补传统细胞术预处理软件的作用,用于光谱分解、转换、可视化和清理,并通过启用流帧和流集到数据帧的转换来帮助进一步的下游分析,例如使用DepecheR。flowCore-compliant自动1D-gating/过滤功能位于管线中。该软件包的名称已被选定,因为它将处理光谱细胞术,并有望为用户提供一副好看的眼镜,通过它可以查看他们的数据。
作者:雅各布·诺尔[aut,cre]
维护人员:雅各布·托雷尔(Jakob Theorell at ki.se>)
引文(从R中输入引文(“flowSpecs”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“flowSpecs”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“flowSpecs”)
细节
生物视图 |
基于细胞的分析,数据导入,数据表示,流式细胞术,免疫肿瘤学,规范化,单个单元格,软件,可视化 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.10(R-3.6)(5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.0) |
进口 |
ggplot2(>= 3.1.0),生物遗传学(>= 0.30.0),生物并行(>= 1.18.1),博科生物(>= 2.48.0),重塑2(>= 1.4.3),flowCore(流动堆芯)(>= 1.50.0),动物园(>=1.8.6),统计(>=3.6.0),方法(>=3.6) |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/jtheorel/flowSpecs/issues |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。