flowSpecs(流量规格)

用于处理高维细胞数据的工具


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在填补传统细胞术预处理软件的作用,用于光谱分解、转换、可视化和清理,并通过启用流帧和流集到数据帧的转换来帮助进一步的下游分析,例如使用DepecheR。flowCore-compliant自动1D-gating/过滤功能位于管线中。该软件包的名称已被选定,因为它将处理光谱细胞术,并有望为用户提供一副好看的眼镜,通过它可以查看他们的数据。

作者:雅各布·诺尔[aut,cre]

维护人员:雅各布·托雷尔(Jakob Theorell at ki.se>)

引文(从R中输入引文(“flowSpecs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“flowSpecs”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“flowSpecs”)
处理原始光谱细胞文件的工作流示例 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,数据导入,数据表示,流式细胞术,免疫肿瘤学,规范化,单个单元格,软件,可视化
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 ggplot2(>= 3.1.0),生物遗传学(>= 0.30.0),生物并行(>= 1.18.1),博科生物(>= 2.48.0),重塑2(>= 1.4.3),flowCore(流动堆芯)(>= 1.50.0),动物园(>=1.8.6),统计(>=3.6.0),方法(>=3.6)
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/jtheorel/flowSpecs/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 流量规格_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 flowSpecs_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 流量规范_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 流量规范_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpecs网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowSpecs
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/flowSpecs网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/flowSpecs网站/
软件包下载报告 下载统计信息