epivizr图表

epiviz web组件的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

这个包提供了一个API,用于使用epiviz web组件对基因组数据进行交互式可视化。R/BioConductor中的对象可以用于生成交互式R标记/笔记本文档,也可以在R Studio的默认查看器中可视化。

作者:Brian Gottfried[aut]、Jayaram Kancherla[aut]Hector Corrada Bravo[aut,cre]

维护人员:赫克托·科拉达·布拉沃(Hector Corrada Bravo)<hcorrada at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“epvizrChart”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“epivizrChart”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“epivizrChart”)
epivizrChart简介 HTML格式 R脚本
使用epvizrChart可视化“RangeSummary dExperiment”对象闪亮的应用程序 HTML格式 R脚本
使用epivizrChart可视化文件 HTML格式 R脚本
使用epivirchart可视化Shiny应用程序中的基因组数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形用户界面,软件,可视化
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0)
进口 epivizrData公司(>= 1.5.1),epivizr服务器,html工具,罗杰森、方法、,生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址
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建议 测试那个,氧气2,针织物,博科生物,基因组范围,S4载体,I范围,总结性实验,反配置文件数据,hgu133加2.db,穆斯库卢斯,仿生风格,猿人,闪亮的,米菲,Rsamtools软件,无线电跟踪器,R彩色啤酒,马格里特,批注中心
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 epivirzr图_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 epivizrChart_1.26.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) epivirzr图_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) epivirzr图_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrChart
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/epivizrChart
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/epivizrChart/
包短Url https://bioconductor.org/packages/epivizrChart/
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