解复用

使用回归混合模型解复用寡核苷酸编码的scRNA-seq数据


生物导体版本:释放(3.19)

用条形码寡核苷酸标记的混合细胞的单细胞测序实验的解复用包。该软件包实现了一些方法,以适应细胞概率分类的回归混合模型,包括多重检测。可以估计解复用错误率,并提供质量控制方法。

作者:汉斯·克莱恩

维护人员:汉斯·克莱恩(Hans-Ulrich Klein)

引文(从R中输入引文(“dexmix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“demoxmix”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“demoxmix”)
使用解复用器解复用信元 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,预处理,回归,排序,单个单元格,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(2年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0)
进口 统计数据,质量,矩阵,ggplot2,额外网格,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/huklein/demoxmix
错误报告 https://github.com/huklein/demoxmix/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 解复用_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 demoxmix_1.6.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 解复用_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) 解复用_1.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/demoxmix网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/解复用
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/demoxmix网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/demoxmix网站/
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