ctsGE公司

时间序列基因表达数据的聚类


生物导体版本:释放(3.19)

时间序列数据集中潜在多个预测变量(如基因等)的监督聚类方法提供了帮助用户将基因分配到预定义模型配置文件集的功能。

作者:Michal Sharabi-Schwager[aut,cre],Ron Ophir[aut]

维护人员:Michal Sharabi-Schwager<michalsharabi at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“ctsGE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ctsGE”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“ctsGE”)
ctsGE包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 贝叶斯主义者,群集,差异表达式,基因表达式,GeneSet扩展,遗传学,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件,时间课程,转录
版本 1.30.0
在生物导体中 生物化学3.4(R-3.3)(8年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.2)
进口 ccaPP公司,ggplot2,利马,重塑2,闪亮的,统计,字符串,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/michalsharabi/ctsGE
错误报告 https://github.com/michalsharabi/ctsGE/issues
查看更多
建议 仿生风格,dplyr公司,DT公司,地理查询,针织物,迎合,rmarkdown公司,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ctsGE_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 ctsGE_1.30.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) ctsGE_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) ctsGE_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ctsGE网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/ctsGE
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ctsGE网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ctsGE/
软件包下载报告 下载统计信息