英国广播公司

Hi-C数据的波段归一化和批量校正


生物导体版本:释放(3.19)

用于从重复数据中规范化(几个)Hi-C数据的工具。

作者:Kipper Fletez-Brant[cre,aut],Kasper Daniel Hansen[aut]

维护人员:Kipper Fletez-Brant<gmail.com>上的cafletzbrant

引文(从R中输入引文(“bnbc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“bnbc”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“bnbc”)
bnbc用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 HiC公司,规范化,预处理,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0),方法,生物遗传学,总结性实验,基因组范围
进口 卢比(>= 0.12.12),I范围,rhdf5型,数据表,基因组信息Db,S4载体,矩阵统计,预处理核心,特别行政区,平行,EB图像,实用程序,HiC支架
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/hansenlab/bnbc
错误报告 https://github.com/hansenlab/bnbc/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,RUnit(运行单位),英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 bnbc_1.26.0.tar.gz公司
Windows二进制 bnbc_1.26.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) bnbc_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) bnbc_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bnbc
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/bnbc/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bnbc/
软件包下载报告 下载统计信息