咆哮

生物导体的聚类算法


生物导体版本:释放(3.19)

将常见的聚类算法封装在一个易于扩展的S4框架中。后端用于分层、k-means和基于图形的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。

作者:亚伦·伦[aut,cre],斯蒂芬妮·希克斯[ctb],巴兹尔·库拜尔[ctb],托马斯·博尔曼[ctb',利奥·拉赫蒂[ctb]

维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文(从R中输入引用(“咆哮”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“bluster”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“咆哮”)
1.聚类算法 HTML格式 R脚本
2.群集诊断 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 群集,基因表达式,免疫肿瘤学,单个单元格,软件,转录组学
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(4年)
许可证 GPL-3公司
取决于
进口 stats、methods、utils、,集群,矩阵,卢比,记录仪,S4载体,生物并行,生物邻居
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址
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链接到 卢比
增强功能
取决于我 OSCA高级、OSCA基本、OSCA简介、OSCA多样本、OSCA工作流、SingleRBook
导入我 表调节子,米娅,scDblFinder,尖叫声,旅行者号,卡内克
建议我 批处理器,ChromS磁带,协和式R,同上顺序,mbkmeans(百万美元),迈阿维兹,MOSim(莫西姆),蒙莫萨,空间DDLS,超级电池
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 布拉斯特_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 蓝色_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64) 布拉斯特_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64) 布拉斯特_1.14.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/吹牛
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/bluster/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bluster/
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