咆哮
生物导体的聚类算法
生物导体版本:释放(3.19)
将常见的聚类算法封装在一个易于扩展的S4框架中。后端用于分层、k-means和基于图形的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。
作者:亚伦·伦[aut,cre],斯蒂芬妮·希克斯[ctb],巴兹尔·库拜尔[ctb],托马斯·博尔曼[ctb',利奥·拉赫蒂[ctb]
维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“bluster”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“咆哮”)
细节
生物视图 |
群集,基因表达式,免疫肿瘤学,单个单元格,软件,转录组学 |
版本 |
1.14.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(4年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
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进口 |
stats、methods、utils、,集群,矩阵,卢比,记录仪,S4载体,生物并行,生物邻居 |
系统要求 |
C++11语言 |
统一资源定位地址 |
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查看更多
建议 |
针织物,rmarkdown公司,测试那个,仿生风格,动态树剪切,单链核糖核酸酶,舷窗,散射,尖叫声,情势图,病毒属,mbkmeans(百万美元),自组织特征映射,ap集群,Dirichlet多项式,素食主义者,快速群集 |
链接到 |
卢比 |
增强功能 |
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取决于我 |
OSCA高级、OSCA基本、OSCA简介、OSCA多样本、OSCA工作流、SingleRBook |
导入我 |
表调节子,米娅,scDblFinder,尖叫声,旅行者号,卡内克 |
建议我 |
批处理器,ChromS磁带,协和式R,同上顺序,mbkmeans(百万美元),迈阿维兹,MOSim(莫西姆),蒙莫萨,空间DDLS,超级电池 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。