生物点火器
从组学数据中发现特征
生物导体版本:释放(3.19)
特征选择在组学数据分析中至关重要,以从复杂和高维数据中提取受限和有意义的分子特征,并建立稳健的分类器。该软件包实现了一种新的方法,用于评估变量对分类器预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA、Random Forest和SVM二进制分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型,以便对新数据集进行未来预测。该包的Galaxy实现可在Workflow4metabolomics.org计算代谢组学在线基础设施中获得。
作者:菲利普·里诺多[aut],艾蒂安·塞维诺[aut,cre]
维护人员:Etienne A.Thevenot<Etienne.Thevenot at cea.fr>
引文(从R中输入引文(“biosigner”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“biosigner”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影(“biosigner”)
细节
生物视图 |
分类,特征提取,脂质组学,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件,转录组学 |
版本 |
1.32.0 |
在生物导体中 |
生物多样性3.3(R-3.3)(8.5年) |
许可证 |
CeCILL公司 |
取决于 |
|
进口 |
博科生物、方法、,e1071号,gr设备,图形,多重分析实验,多数据集,随机森林,ropls公司,统计,总结性实验,实用程序 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2016.0026 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。