生物测定R
小分子生物活性的交叉靶点分析
生物导体版本:释放(3.19)
生物测定R是一种计算工具,可以同时分析针对不同化合物和生物靶标进行的数千个生物测定实验。独特的功能包括支持公共和自定义生物测定的大规模交叉目标分析,生成高通量筛选指纹(HTSFP),以及可选的预加载数据库,该数据库提供了对大量公共可用生物活性数据的访问。
作者:Tyler Backman、Ronly Schlenk、Thomas Girke
维护人员:丹妮拉·卡索尔(Daniela Cassol)
引文(从R中输入引文(“bioassayR”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物测定管理器::安装(“生物测定器”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“生物测定R”)
细节
生物视图 |
生物信息学,基于细胞的分析,数据导入,免疫肿瘤学,基础设施,代谢组学,微量滴定平板分析,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 |
1.42.0 |
在生物导体中 |
生物技术2.13(R-3.0)(11年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5.0),数据库接口(>= 0.3.1),RSQ网站(>=1.0.0),方法,矩阵,罗杰森,生物遗传学(>= 0.13.8) |
进口 |
XML格式,化学工程师 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/girke-lab/bioassayR |
错误报告 |
https://github.com/girke-lab/ibioassayR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。