生物测定R

小分子生物活性的交叉靶点分析


生物导体版本:释放(3.19)

生物测定R是一种计算工具,可以同时分析针对不同化合物和生物靶标进行的数千个生物测定实验。独特的功能包括支持公共和自定义生物测定的大规模交叉目标分析,生成高通量筛选指纹(HTSFP),以及可选的预加载数据库,该数据库提供了对大量公共可用生物活性数据的访问。

作者:Tyler Backman、Ronly Schlenk、Thomas Girke

维护人员:丹妮拉·卡索尔(Daniela Cassol)

引文(从R中输入引文(“bioassayR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物测定管理器::安装(“生物测定器”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“生物测定R”)
生物测定R简介和示例 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物信息学,基于细胞的分析,数据导入,免疫肿瘤学,基础设施,代谢组学,微量滴定平板分析,蛋白质组学,软件,可视化
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(11年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0),数据库接口(>= 0.3.1),RSQ网站(>=1.0.0),方法,矩阵,罗杰森,生物遗传学(>= 0.13.8)
进口 XML格式,化学工程师
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/girke-lab/bioassayR
错误报告 https://github.com/girke-lab/ibioassayR/issues
查看更多
建议 仿生风格,RCurl(RCurl),生物电阻,单元格HTS2,针织物,针织物,针织靴带,测试那个,ggplot2,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物测定R_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 生物测定R_1.42.0.zip
macOS二进制(x86_64) 生物测定R_1.42.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioassayR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/生物测定
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ibioassayR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bioassayR/
软件包下载报告 下载统计信息