生物癌
交互式多组癌症数据可视化与分析
生物导体版本:释放(3.19)
此软件包是一个闪亮的应用程序,用于可视化和交互式分析癌症基因组数据的多分析。
作者:卡里姆·梅周德[aut,cre]
维护人员:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)<kmezhoud at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“bioCancer”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“生物癌”)
细节
生物视图 |
数据表示,图形用户界面,基因表达式,基因靶点,多重比较,网络,路径,反应途径,软件,可视化 |
版本 |
1.32.0 |
在生物导体中 |
生物化学3.4(R-3.3)(8年) |
许可证 |
AGPL-3 |文件许可证 |
取决于 |
R(>=3.6.0),弧度数据(>= 0.9.1),cBioPortalData公司,XML格式(>= 3.98) |
进口 |
R.oo公司,R.方法S3,DT公司(>= 0.3),dplyr公司(>= 0.7.2),三年,闪亮的(>= 1.0.5),AlgDesign公司(>= 1.1.7.3),进口(>=1.1.0),方法,注释Dbi,发光体,博科生物,geNet分类器,组织Hs.eg.db,组织Bt.eg.db,剂量,clusterProfiler(群集探查器),反应.db,反应omePA,图R(<= 1.01),visNetwork(可视网络),html小部件,胶合板,易怒的,政府.db |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://kmezhoud.github.io/生物癌/ |
错误报告 |
https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。