批处理器
单细胞批量校正方法
生物导体版本：释放（3.19）
实现单细胞（RNA测序）数据的批量校正的各种方法。这包括基于检测相互最近邻居的方法，以及对数表达式值线性回归的几个有效变体。还提供了执行全局缩放的功能，以消除批次之间的深度差异，并执行对批次间细胞数量差异稳健的主成分分析。
作者：亚伦·伦[aut，cre]，拉勒·哈格沃尔迪[ctb]
维护人员：亚伦·伦（Aaron Lun）<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“batchelor”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“批处理程序”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“批处理程序”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,基因表达式,规范化,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.20.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.9（R-3.6）（5.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
单细胞实验 |
| 进口 |
总结性实验,S4载体,生物遗传学,卢比，统计信息，方法，实用程序，记录仪,生物邻居,BiocSingular公司,矩阵,DelayedArray（延迟阵列）,延迟矩阵统计,生物并行,舷窗,残差矩阵,缩放矩阵,海滩上的人 |
| 系统要求 |
C++11语言 |
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
测试那个,仿生风格,针织物,rmarkdown公司,尖叫声,散射,咆哮,单链核糖核酸酶 |
| 链接到 |
卢比 |
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
OSCA高级、OSCA简介、OSCA多采样、OSCA工作流 |
| 导入我 |
ChromS磁带,蒙莫萨,sc合并,单细胞TK,SCInt标尺 |
| 建议我 |
TSCAN公司,卡内克,赛道ID |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
