绝对值R
抗体库Rep-Seq数据集的报告和数据分析功能
生物导体版本:释放(3.19)
AbSeq是用于分析抗体库生成的测序数据集的综合生物信息管道,abseqR是其软件包之一。abseqR授权abseqPy的用户(https://github.com/malhamdoosh/abseqPy)具有绘图和报告功能,并允许他们生成交互式HTML报告,以便与其他研究人员查看和共享。此外,dropiqR扩展了dropiqPy,以比较多个曲目分析,并对其输出进行进一步的下游分析。
作者:JiaHong Fong[cre,aut]、Monther Alhamdoosh[aut]
维护人员:JiaHong Fong在gmail.com>上的jiahfong
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“下降R”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“abseqR”)
细节
生物视图 |
多重比较,质量控制,报告写作,排序,软件,可视化 |
版本 |
1.22.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.8(R-3.5)(6年) |
许可证 |
GPL-3|文件许可证 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
ggplot2,R彩色啤酒,绕圈子,重塑2,维恩图,普利尔,柔性仪表板,生物并行(>= 1.1.25),png公司,网格,额外网格,rmarkdown公司,针织物,素食主义者,ggcorrplot图,ggdendro公司,巧妙地,仿生风格,字符串、utils、methods、grDevices、stats、tools、graphics |
系统要求 |
潘多克(>=1.19.2.1) |
统一资源定位地址 |
https://github.com/malhamdoosh/abseqR |
错误报告 |
https://github.com/malhamdoosh/abseqR/issues |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。