Zygosity预测器
NGS数据中变体/基因的合子预测包
生物导体版本：释放（3.19）
ZygosityPredictor可以预测一个基因有多少拷贝受到小变异的影响。除了对变异的受影响拷贝数进行基本计算外，Zygosity-Pirector还可以整合多个变异对基因的影响，并最终声明是否存在以及存在多少野生型基因拷贝。这一信息在转化医学的背景下被证明是特别有用的。例如，在癌症基因组中，Zygosity-Pindicator可以确定是否存在未突变的抑癌基因拷贝。除此之外，还可以对生物体的所有基因做出这样的声明。Zygosity预测器主要用于处理体细胞和种系起源的SNV和INDEL（后来称为小变异）。为了不忽视小变异背景之外的严重影响，我们扩展了对大规模缺失的评估，这些缺失会导致整个基因或部分基因的丢失。
作者：马可·莱因内克
、马克·鲁布萨姆[aut]、丹尼尔·胡布施曼[aut]:Martina Froehlich[aut:aut]
维护人员：马克·莱因内克（Marco Rheinnecker）
引文（从R中输入引文（“ZygosityPredictor”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“ZygosityPredictor”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“ZygosityPredictor”）
细节
| 生物视图 |
生物医学信息学,功能预测,基因预测,软件,体细胞突变 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年） |
| 许可证 |
GPL-2型 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
基因组比对,基因组范围,Rsamtools软件,I范围,变量注释,DelayedArray（延迟阵列）,dplyr公司,字符串,呜呜声,易怒的、方法、，针织物,记录仪,阅读器，统计，马格里特,爱尔兰航空公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
