顶部

TOP构建跨基因表达平台的可转移模型


生物导体版本:释放(3.19)

TOP为前瞻性实验构建了跨基因表达平台的可转移模型。这样一个可转移模型可以被训练成对独立验证数据进行预测,其准确性类似于再替代模型。TOP程序还具有灵活性,可以适应最常见的临床反应变量,包括线性反应、二项式和Cox PH模型。

作者:哈里·罗伯逊,尼古拉斯·罗伯逊

维护人员:哈里·罗伯逊(Harry Robertson)

引文(从R中输入引文(“TOP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“TOP”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“顶部”)
TOP简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基因表达式,软件,生存
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0)
进口 断言,插入符号,类别R,直接PA,do并行,dplyr公司,gg新闻量表,ggplot2,gggraph图,gg排斥,ggthemes主题,格尔姆奈特,Hmisc公司,记录仪,最晚2个月,利马,马格里特、方法、,巧妙地,pROC公司,呜呜声,重塑2,统计,字符串,生存,易怒的,潮汐记录仪,三年,随机反演
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Harry25R/TOP网站
错误报告 https://github.com/Harry25R/TOP/问题
查看更多
建议 针织物,rmarkdown公司,仿生风格,博科生物,管理的卵巢数据,蜂群,ggsci公司,监督员,潮韵诗
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 顶部_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 上衣_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) 顶部_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) 顶部_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TOP
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/TOP
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/TOP网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/TOP/
软件包下载报告 下载统计信息