TMixClust俱乐部

基于高斯混合效应模型和光滑样条的基因表达时间序列聚类


生物导体版本:释放(3.19)

基于带有高斯变量和非参数三次样条估计的混合效应模型的时间序列基因表达数据聚类方法的实现。该方法可以很好地解释典型基因表达时间序列数据中存在的高水平噪声。

作者:莫妮卡·格伦贝努(Monica Golumbeanu)<Golumbeanu.Monica at gmail.com>

维护人员:莫妮卡·格伦贝努(Monica Golumbeanu)<Golumbeanu.Monica at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“TMixClust”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“TMixClust”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“TMixClust”)
用TMixClust聚类时间序列基因表达数据 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 群集,基因表达式,软件,统计方法,时间课程
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.4)
进口 全球供应链,mvtnorm公司,统计,动物园,集群,实用程序,生物并行,弗莱克斯集群,gr设备,图形,博科生物,SPEM公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 TMix俱乐部_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 TMixClust_1.26.0.zip公司(仅64位)
macOS二进制(x86_64) T混合信号_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) TMix俱乐部_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/TMixClust
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/TMixClust网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/TMixClust网站/
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