SiPSiC公司

计算scRNA-Seq数据中每个细胞的通路得分

生物导体版本：释放（3.19）

通过计算每个细胞的通路得分（通路基因由用户指定），从单细胞RNA测序数据推断细胞的生物通路活性。为了获得最佳结果，建议使用百万分之成绩单（TPM）或百万分之计数（CPM）单位的数据。在数据中添加单元格或从数据中删除单元格时，分数可能会更改。SiPSiC代表单细胞中的单通道分析。

作者：丹尼尔·戴维斯，约坦干燥器[aut]

维护人员：丹尼尔·戴维斯＜DanielDavis000在gmail.com＞

引文（从R中输入引文（“SiPSiC”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SiPSiC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“SiPSiC”）

生物视图	生物医学信息学,细胞生物学,数据导入,差异表达式,GeneSet扩展,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录,转录组学
版本	1.4.3
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年）
许可证	文件许可证
取决于	矩阵,单细胞实验
进口
系统要求
统一资源定位地址	https://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.278431.123
错误报告	https://github.com/DanielDavis12/SiPSiC/issues网站

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	SiPSiC_1.4.3.tar.gz公司
Windows二进制	SiPSiC_1.4.3.zip文件
macOS二进制（x86_64）	SiPSiC_1.4.3.tgz合金
macOS二进制（arm64）	SiPSiC_1.4.1.tgz合金
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SiPSiC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/SiPSiC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SiPSiC网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SiPSiC/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档