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SeqVarTools（序列变量工具）

变量数据工具


生物导体版本：释放（3.19）

SeqArray中提供的VCF数据快速存取存储格式的接口，带有用于常见操作和分析的工具。

作者：斯蒂芬妮·戈加滕（Stephanie M.Gogarten）、郑秀文（Xiuwen Zheng）、阿德里安·斯蒂尔普（Adrienne Stilp）

维护人员：Stephanie M.Gogarten<sdmorris在uw.edu>

引文（从R中输入引文（“SeqVarTools”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SeqVarTools”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“SeqVarTools”）
SeqVarTools简介 PDF格式 R脚本
SeqVarTools中的迭代器 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

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细节

生物视图 遗传变异性,遗传学,SNP公司,排序,软件
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.13（R-3.0）（11年）
许可证 GPL-3公司
取决于 SeqArray（序列阵列）
进口 gr设备、图形、统计、方法，博科生物,生物遗传学,gdsfmt公司,基因组范围,I范围,S4载体,GWASExactHW公司,后勤人员,矩阵,数据表
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/smgogarten/SeqVarTools网站
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建议 仿生风格,RUnit（运行单位）,字符串
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 序列变量工具_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 SeqVarTools_1.42.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64） 序列变量工具_1.42.0.tgz
macOS二进制（arm64） 序列变量工具_1.42.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools网站
源存储库（开发人员访问） git克隆git@git.bioconductor.org：包/SeqVarTools
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SeqVarTools网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/SeqVarTools/
软件包下载报告 下载统计信息