Rhtslib公司

HTSlib高通量测序库作为R包


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包提供1.18版的“HTSlib”C库,用于高通量序列分析。该软件包主要用于希望使用HTSlib的其他R软件包的开发人员。使用此软件包的动机和说明见vignette,vignetet(package=“Rhtslib”,“Rhtsbib”)。

作者:纳撒尼尔·海登[led,aut],马丁·摩根[aut],赫维·帕格斯[aut,cre],托马斯·卡利贝拉[ctb],杰罗恩·乌姆斯[ctb]

维护人员:HervéPagès<hpages.on.github at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“Rhtslib”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“Rhtslib”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“Rhtslib”)
Rhtslib的动机和使用 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,排序,软件
版本 3.0.0
在生物导体中 生物多样性3.1(R-3.2)(9.5年)
许可证 LGPL(>=2)
取决于
进口 工具,zlibbico公司
系统要求 libbz2&liblzma&libcurl(带有头文件),GNU生成
统一资源定位地址 https://bioconductor.org/packages/Rhtslib网站 网址:http://www.htslib.org/
错误报告 https://github.com/Bioconductor/Rhtslib/issues
查看更多
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链接到 zlibbico公司
增强功能
取决于我
导入我 深SNV,差异Hic,黑手党,丝裂原克隆2,sc管道
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指向我的链接 竹信号,计算机辅助焊接,深SNV,差异绑定,差异Hic,表等位基因R,火焰,h5vc公司,黑手党,甲基试剂盒,丝裂原克隆2,podkat公司,QuasR公司,雷尔,快速响应,Rsamtools软件,sc管道,ShortRead(短阅读),TransView公司,变量注释,鹿角兔
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 Rhtslib_3.0.0.tar.gz
Windows二进制 Rhtslib_3.0.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) Rhtslib_3.0.0.tgz文件
macOS二进制(arm64) Rhtslib_3.0.0.tgz文件
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rhtslib网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/Rhtslib
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Rhtslib网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Rhtslib网站/
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