雷德(Rede R)

嵌套网络的交互式可视化和操作


生物导体版本:释放(3.19)

RedeR是一个基于R的软件包,与一个独立的Java应用程序相结合,用于交互式可视化和操作嵌套网络。可以使用图形或命令行方法,按照igraph语法规则配置图形、节点和边属性。

作者:Xin Wang,Florian Markowetz,Mauro Castro

维护人员:毛罗·卡斯特罗(Mauro Castro)<Mauro.a.Castro at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“RedeR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RedeR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“RedeR”)
RedeR:嵌套网络 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形用户界面,图形和网络,网络,网络丰富,网络推理,软件,系统生物学
版本 3.0.0
在生物导体中 生物C 2.9(R-2.14)(13岁)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.0),方法
进口 规模,记录仪
系统要求 Java运行时环境(Java>=11)
统一资源定位地址 https://doi.org/10.1186/gb-2012-13-4-r29
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 雷德R_3.0.0.tar.gz
Windows二进制 重新定义R_3.0.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 重新定义R_3.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) 重新定义R_3.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RedeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/RedeR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RedeR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RedeR/
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