收音机Gx

大规模放射基因组数据分析


生物导体版本:释放(3.19)

用于放射基因组分析的计算工具箱,集成了数百种癌症细胞系的放射响应数据、放射生物学建模和综合细胞系注释。“RadioSet”类支持创建和操作标准化数据集,包括有关癌细胞株、放射反应分析和剂量反应指标的信息。包括的方法允许使用已建立的放射生物学模型拟合和绘制剂量反应数据,并进行质量控制以验证结果。包括与拟合和绘制剂量反应曲线、量化统计相关性和计算曲线下面积(AUC)或存活率(SF)相关的其他功能。有关更多详细信息,请参阅所附文件、参考资料以及:Manem,V.等人(2018).

作者:文卡塔·马内姆[aut]、彼得·斯米尔诺夫[aut]]、伊恩·史密斯[aut]、梅根·兰比[autneneneea、克里斯托弗·埃利斯[aut'、斯科特·布拉特曼[autneneneei、杰米亚·约瑟夫[aut】、本杰明·海贝-凯恩斯[aut,cre]

维护人员:本杰明·海贝-凯恩斯(Benjamin Haibe.Kains)

引文(从R中输入引文(“RadioGx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RadioGx”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“RadioGx”)
RadioGx:用于分析大型放射基因组数据集的R包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,药物遗传学,药物基因组学,质量控制,软件,生存
版本 2.8.0
在生物导体中 生物C 3.12(R-4.0)(4年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1),核心Gx
进口 总结性实验,生物遗传学,数据表,S4载体,博科生物,平行,生物并行,R彩色啤酒,ca工具,魔术、方法、,重塑2,规模,grDevices,图形,统计数据,实用程序,断言,矩阵统计,下载器
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 收音机Gx_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 收音机Gx_2.8.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 收音机Gx_2.8.0.tgz
macOS二进制(arm64) 收音机Gx_2.8.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RadioGx
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/RadioGx
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RadioGx网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RadioGx/
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