RVS公司

计算相关个体共享罕见变体的概率估计


生物导体版本:释放(3.19)

罕见变异共享(RVS)在家族样本中对罕见遗传变异基因型和二分法表型(例如疾病状态)之间的关联和联系进行测试。这些测试基于亲属在罕见变异和表型之间缺乏连锁和关联的无效假设下共享罕见变异的概率,并适用于一个地区的单个变异或多个变异(例如基于基因的测试)。

作者:亚历山大局、英戈·鲁钦斯基、塞缪尔·扬金、托马斯·谢尔曼

维护人员:亚历山大局<Alexandre.Bureau at fmed.ulaval.ca>

引文(从R中输入引文(“RVS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RVS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“RVS”)
RVS包 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 Exome序列,遗传学,基因组广泛协会,免疫肿瘤学,软件,变量检测,全基因组
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.5.0)
进口 GENLIB公司,g雨,snpStats(snpStat),亲属关系2,方法,统计,实用程序,R.utils公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 RVS_1.26.0.tar.gz号
Windows二进制 RVS_1.26.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) RVS_1.26.0.tgz号
macOS二进制(arm64) RVS_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RVS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/RVS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RVS网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RVS/
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