RTN工具

“双重调节子”的协同调节与推理分析


生物导体版本:释放(3.19)

RTNduals是一种工具,用于搜索RTN包生成的调节子对之间可能的协同调节回路。它比较了共享目标,以推断出“双重规则”,这是一个新概念,用于测试监管机构在影响目标方面是否可以合作或竞争。

作者:Vinicius S.Chagas、Clarice S.Groeneveld、Gordon Robertson、Kerstin B.Meyer、Mauro A.Castro

维护人员:毛罗·卡斯特罗(Mauro Castro)<Mauro.a.Castro at gmail.com>,克拉丽斯·格罗内维尔德(Clarice Groneveld)<clari.Groeneveld at gmail.com)

引文(从R中输入引文(“RTNduals”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RTNduals”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“RTNduals”)
RTN数据:双调节子的共同调节和推断分析。 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,基因调控,图形和网络,网络丰富,网络推理,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 生物碳3.5(R-3.4)(7.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6.3),RTN公司(>=2.14.1),方法
进口 图形、grDevices、stats、utils
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 RTN数字_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 RTN双_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64) RTN值_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) RTN值_1.28.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTNduals网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/RTNuals
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RTN网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RTNduals网站/
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