RGMQL公司
R/生物导体的基因测量查询语言
生物导体版本：释放（3.19）
此包将GenoMetric查询语言（GMQL）功能引入R环境。GMQL是一种高级声明性语言，用于管理用于生物医学目的的异构基因组数据集，使用简单的查询处理基因组区域及其元数据和属性。GMQL采用了使用云计算技术（如Apache Hadoop和Spark）为大数据高效设计的算法，允许GMQL在现代基础设施上运行，以实现可扩展性和高性能。它允许从本地和远程的不同数据源创建、操作和提取基因组数据。我们的RGMQL函数允许利用R惯用范式进行复杂查询和处理。RGMQL包还提供了一组丰富的辅助类，允许复杂的输入/输出管理和排序，例如：ASC、DESC、BAG、MIN、MAX、SUM、AVG、MEDIAN、STD、Q1、Q2、Q3（以及许多其他类）。请注意，许多RGMQL函数不是在R环境中直接执行的，而是延迟到发出实际执行。
作者：西蒙·帕洛塔[aut，cre]，马可·马塞罗利[aut]
维护人员：西蒙·帕洛塔（Simone Pallotta）<simonepallotta at hotmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“RGMQL”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“RGMQL”）
细节
| 生物视图 |
数据导入,免疫肿瘤学,基础设施,网络,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.24.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.4.2），RGMQL库 |
| 进口 |
高温气冷堆,rJava软件,基因组范围,无线电跟踪器,数据表，实用程序，普利尔,xml语言2、方法、，S4载体,数字播放器，统计，胶,生物遗传学 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
http://www.bioinformatics.deib.polimi.it/genomic_computing/GMQL/ |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
