Q功能

质谱数据的定量特征


生物导体版本:释放(3.19)

QFeatures基础设施能够管理和处理高通量质谱分析的定量特征。它提供了一种熟悉的Bioconder用户体验,以连贯和易处理的格式管理不同分析水平(如肽谱匹配、肽和蛋白质)的定量数据。

作者:劳伦特·加托[aut,cre],克里斯托弗·范德拉

维护人员:劳伦特·加托

引文(从R中输入引文(“QFeatures”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“QFeatures”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“QFeatures”)
QFeatures对象的数据可视化 HTML格式 R脚本
利用QFeatures处理定量蛋白质组学数据 HTML格式 R脚本
质谱数据的定量特征 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本 1.14.2
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(4年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),多重分析实验
进口 方法、stats、utils,S4载体,I范围,总结性实验,生物遗传学,ProtGenerics公司(>= 1.35.1),批注筛选器,懒惰的,博科生物,MsCoreUtils(MsCore实用程序)(>= 1.7.2),记录仪,gr设备,巧妙地,第三年,潮汐选择,重塑2
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/Q特性
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/QFeatures/issues网站
查看更多
建议 单细胞实验,MsDataHub(消息数据中心)(>= 1.3.3),矩阵,HDF5阵列,msdata(msdata),ggplot2,gplots(gplots),数字播放器,利马,DT公司,闪亮的,闪亮的仪表板,测试那个,针织物,仿生风格,rmarkdown公司,vsn(vsn),预处理核心,矩阵统计,插补LCMD,pca方法,插补,规范,复杂热图
链接到
增强功能
取决于我 hdxmsqc,msqrob2,供应链计划,scpdata数据
导入我 元数据库注释,理学硕士实验,PS匹配
建议我 MsDataHub(消息数据中心)
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 Q特征_1.14.2.tar.gz
Windows二进制 Q功能_1.14.2.zip
macOS二进制(x86_64) Q特征_1.14.2.tgz
macOS二进制(arm64) Q特征_1.14.2.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QFeatures网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/Q功能
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/QFeatures网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/QFeatures(https://bioductor.org/packages/QFeatures)/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档