药物Gx

大规模药物基因组数据分析

生物导体版本：释放（3.19）

包含一组函数，用于对药物基因组数据进行大规模分析。其中包括用于存储药物基因组实验结果的PharmaceSet对象，以及用于计算药物剂量反应的常见摘要并将其与癌细胞系中的分子特征关联的许多函数。

作者：Petr Smirnov[aut]、Christopher Eeles[aut]]、Jermiah Joseph[aut]、Zhaleh Safikhani[aut】、Mark Freeman[aut）、Feifei Li[aut'、Benjamin Haibe-Kains[aut，cre]

维护人员：本杰明·海贝-凯恩斯（Benjamin Haibe.Kains）

引文（从R中输入引文（“PharmacoGx”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PharmaceGx”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“PharmacoGx”）

创建药物集对象	HTML格式	R脚本
使用PharmaceGx 3.0检测药物协同和拮抗作用+	HTML格式	R脚本
PharmaceGx：用于分析大型药物基因组数据集的R包	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	分类,基因表达式,药物遗传学,药物基因组学,软件
版本	3.8.0
在生物导体中	生物化学3.4（R-3.3）（8年）
许可证	GPL（>=3）
取决于	R（>=3.6），核心Gx
进口	生物遗传学,博科生物,S4载体,总结性实验,多重分析实验,生物并行,ggplot2,R彩色啤酒,魔术，平行，ca工具、方法、，下载器，统计数据，实用工具，图形，grDevices，重塑2,jsonlite公司,数据表,将死,靴子,笼子
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/bhklab/PropaceGx/issues网站

建议	迎合,rmarkdown公司,针织物,针织物,蜡笔,测试那个,降价,仿生风格,R.utils公司
链接到	卢比
增强功能
取决于我
导入我	gDR导入,Xeva公司
建议我	毒物Gx
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	药物Gx_3.8.0.tar.gz
Windows二进制	药物Gx_3.8.0.zip
macOS二进制（x86_64）	药物Gx_3.8.0.tgz
macOS二进制（arm64）	药物Gx_3.8.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PharmacGx网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/药典Gx
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ParcipacGx网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/PharmaceGx/
软件包下载报告	下载统计信息