管道

基于Term-Seq数据的峰值泊松识别

生物导体版本：释放（3.19）

PIPETS为3'-seq/term-seq数据提供了统计稳健的分析。它利用滑动窗口方法应用泊松分布测试来识别终止读数覆盖率显著高于周围信号的基因组位置。PIPETS然后对近端信号进行压缩，并产生包含所有显著终止峰的链特定结果。

作者：昆兰·富鲁莫[aut，cre]

维护人员：昆兰·富鲁莫（Quinlan Furumo）

引文（从R中输入引文（“PIPETS”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PIPETS”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“PIPETS”）

生物视图	新闻报道,基因调控,遗传学,峰值检测,排序,软件,转录,转录组学
版本	1.0.3
在生物导体中	生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.4.0）
进口	dplyr公司，实用程序，统计信息，基因组范围,生物遗传学，方法
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/qfurumo/PIPETS网站
错误报告	https://github.com/qfurumo/PIPETS/issues网站

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	管道_1.0.3.tar.gz
Windows二进制	管道_1.0.3.zip
macOS二进制（x86_64）	管道_1.0.3.tgz
macOS二进制（arm64）	管道_1.0.3.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PIPETS
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/PIPETS
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/PIPETS网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/PIPETS/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档