Ms质量
MsQuality—从Spectra和MsExperiment对象计算质量度量
生物导体版本：释放（3.19）
MsQuality提供了在每个样本级别计算质谱衍生光谱数据的质量指标的功能。MsQuality依赖于人类蛋白质组学组织蛋白质组学标准倡议（HUPO-PSI）定义的质量度量的mzQC框架。这些度量使用受控词汇量化光谱原始文件的质量。该软件包特别面向大规模获取质谱数据的用户（例如，由数千个样本组成的临床设置数据集）。MsQuality包允许计算低水平质量指标，这些指标需要质谱数据的最少信息：保留时间、m/z值和相关强度。MsQuality依赖于Spectra包或MsExperiment包及其存储光谱数据的基础设施。
作者：托马斯·纳克
，约翰·雷纳[aut]
维护人员：托马斯·纳克（Thomas Naake）<googlemail.com>
引文（从R中输入引文（“MsQuality”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MsQuality”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
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细节
| 生物视图 |
质谱学,代谢组学,蛋白质组学,质量控制,软件 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
生物并行(>= 1.32.0),ggplot2(>= 3.3.5),html小部件（>=1.5.3），方法（>=4.2.0），msdata（msdata）(>= 0.32.0),理学硕士实验(>= 0.99.0),巧妙地(>= 4.9.4.1),ProtGenerics公司(>= 1.24.0),爱尔兰航空公司(>= 1.1.1),rmzqc公司(>= 0.5.0),闪亮的(>= 1.6.0),闪亮的仪表板(>= 0.7.1),光谱（>=1.13.2），统计（>=4.2.0），字符串(>= 1.4.0),易怒的(>= 3.1.4),三年（>=1.1.3），实用程序（>=4.2.0） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://www.github.com/tnaake/MsQuality网站/ |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
