消息功能

质谱特征的功能


生物导体版本:释放(3.19)

MsFeature包定义质谱特征的功能。这包括根据特征的某些属性对特征进行分组(LC-MS)的功能,例如保留时间(协同特征)或样本间信号的相关性。因此,此包允许对功能进行分组,其结果可以用作“QFeatures”包的输入,该包允许在每个组中聚合丰富的功能级别。该包定义了基本和通用数据类型的概念和函数,更具体的数据类型的实现预计将在相应的包中实现(例如“xcms”)。此软件包的所有功能均以模块化方式实现,允许组合不同的分组方法,并允许在其他R软件包中重复使用。

作者:约翰内斯·雷纳[aut,cre]

维护人员:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)。欧洲大学的Rainer

引文(从R中输入引文(“MsFeatures”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MsFeatures”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MsFeatures”)
质谱特征分组 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,质谱学,代谢组学,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物柴油3.13(R-4.1)(3.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1)
进口 方法,ProtGenerics公司(>= 1.23.5),MsCoreUtils(MsCore实用程序),总结性实验,统计信息
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/Ms功能
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsFeatures/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 消息功能_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 邮件功能_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) Ms功能_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 消息功能_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsFeatures网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MsFeatures
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Ms功能/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MsFeatures网站/
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