分子实验
空间转录组学数据分子级存储的优先级
生物导体版本:释放(3.19)
MoleculeExperiment包含创建和使用新MoleculeLaberiment类中的对象的函数。我们引入这一类用于分析基于分子的空间转录组学数据(例如,Xenium by 10X,Cosmx SMI by Nanostring,Merscope by Vizgen)。这使得研究人员能够在分子水平上分析空间转录组学数据,并在供应商之间建立标准化的数据格式。
作者:Bárbara Zita Peters Couto[aut]、Nicholas Robertson[aut]、Ellis Patrick[aut'、Shila Ghazanfar[aut,cre]
维护人员:希拉·加扎法尔(Shila Ghazanfar)<shazanfar at gmail.com>
安装
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如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“分子实验”)
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文档
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浏览幻影(“分子实验”)
细节
生物视图 |
数据导入,数据表示,基础设施,软件,空间,转录组学 |
版本 |
1.4.1 |
在生物导体中 |
生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=2.10) |
进口 |
空间实验,矩阵,呜呜声,数据表,数字播放器(>= 1.1.1),马格里特,罗杰森,实用程序,方法,特拉,ggplot2,爱尔兰航空公司,克莱,EB图像,rhdf5型,生物并行,S4载体,统计信息 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/SydneyBioX/分子实验 |
错误报告 |
https://github.com/SydneyBioX/分子实验/问题 |
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程序包档案
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