元数据库注释
代谢组学数据注释实用程序
生物导体版本:释放(3.19)
高级功能,用于帮助注释(代谢组学)数据集。这些功能包括基于质量匹配执行简单的初步注释的功能,也包括考虑m/z和保留时间的功能,以注释LC-MS特征,前提是各参考值可用。此外,该功能还提供高级功能,以简化LC-MS/MS光谱与光谱库和对象的匹配,以及表示和管理此类匹配数据的功能。
作者:迈克尔·威廷,约翰内斯·雷纳[aut,cre],安德烈·维奇尼[aut],卡罗琳·胡贝尔,菲律宾路易[aut],尼尔·沙沙夫[ctb]
维护人员:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)。欧洲大学的Rainer
引文(从R中输入引文(“MetaboAnnotation”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MetaboAnnotation”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“MetaboAnnotation”)
细节
生物视图 |
基础设施,质谱学,代谢组学,软件 |
版本 |
1.8.1 |
在生物导体中 |
生物C 3.15(R-4.2)(2.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.0) |
进口 |
生物遗传学,MsCoreUtils(MsCore实用程序),MetaboCoreUtils(元核心实用程序),ProtGenerics公司、方法、,S4载体,光谱(>= 1.13.2),生物并行,总结性实验,Q功能,批注中心、图形、,复合Db |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboAnnotation网站 |
错误报告 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboAnnotation/issues网站 |
查看更多
建议 |
测试那个,针织物,msdata(msdata),仿生风格,rmarkdown公司,巧妙地,闪亮的,闪亮的牛仔裤,DT公司,微基准,毫兹罗 |
链接到 |
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增强功能 |
RMariaDB数据库,RSQ网站 |
取决于我 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。