MS状态MT

基于串联质谱标记的鸟枪质谱蛋白质组学实验中的蛋白质意义分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了统计工具，用于在串联质谱（TMT）标记的鸟枪质谱蛋白质组实验中检测差异丰富的蛋白质。它提供了多种功能，包括aata可视化、蛋白质定量和标准化以及统计建模和推断。此外，它还可以与其他数据处理工具互操作，如Proteome Discoverer、MaxQuant、OpenMS和SpectroMine。

作者：德文·科勒[aut，cre]，黄婷[aut]，崔美娜[aut]Mateusz Staniak[aut'，郝思成[aut:

维护人员：德文·科勒（Devon Kohler）<Kohler.d at东北部.edu>

引文（从R中输入引文（“MSstatsTMT”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MSstatsTMT”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MSstatsTMT”）

MSstatsTMT用户指南	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	免疫肿瘤学,质谱学,蛋白质组学,软件
版本	2.12.1
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（6年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2）
进口	利马,lme4公司,lmer测试、方法、，数据表，统计数据，实用程序，ggplot2，gr设备，图形，MS统计,MS统计转换,将死,巧妙地,html工具
系统要求
统一资源定位地址	http://msstats.org/msstatstmt/
错误报告	https://groups.google.com/forum网站/#!论坛/msstats

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我	MS统计PTM,MSstats闪亮
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MS统计MT_2.12.1.tar.gz
Windows二进制	MSstatsTMT_2.12.1.zip软件
macOS二进制（x86_64）	MStatsTMT_2.12.1.tgz微软统计数据
macOS二进制（arm64）	MS统计MT_2.12.1.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsTMT网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MSstatsTMT
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsTMT网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MSstatsTMT网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档