财政部2
多目标因素分析v2
生物导体版本:释放(3.19)
MOFA2包包含一系列用于培训和分析多经济因素分析(MOFA)的工具。MOFA是一种概率因子模型,旨在从包含多个组学层和/或样本组的数据集中识别变化主轴。关于样本的额外时间或空间信息可以使用MEFISTO框架合并,该框架是MOFA2的一部分。下游分析功能可用于检查每个因子的分子特征,即化、插补等。
作者:里卡德·阿格拉盖[aut,cre],达米安·阿诺尔,Danila Bredikhin[aut],布丽塔·维尔滕[aut]
维护人员:Ricard Argelaguet在gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MOFA2”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“MOFA2”)
细节
生物视图 |
贝叶斯主义者,尺寸缩减,软件,可视化 |
版本 |
1.14.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(4年) |
许可证 |
文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.0) |
进口 |
rhdf5型,数字播放器,第三年,重塑2,情势图,ggplot2、方法、,R彩色啤酒,奶牛场,gg排斥,网状的,HDF5阵列,gr设备,统计,马格里特,对于猫,实用程序,校正图,DelayedArray(延迟阵列),Rtsne公司,超高速,蛇怪,斯特林吉 |
系统要求 |
Python(>=3)、numpy、pandas、h5py、scipy、argparse、sklearn、moapy2 |
统一资源定位地址 |
https://biofam.github.io/MOFA2/index.html |
错误报告 |
https://github.com/bioFAM/MOFA2网站 |
查看更多
建议 |
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程序包档案
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