MBECS系统
微生物组数据中批量效应的评估和校正
生物导体版本:释放(3.19)
微生物组分批效应校正套件(MBECS)提供了一组功能,用于评估和缓解分批加工产生的未经处理的噪音。为此,它结合了来自不同软件包的大量批纠正算法(BECA)。此外,它还提供了一个校正和报告管道,可以初步查看在校正批量效应之前和之后数据集的特性。
作者:迈克尔·奥尔布里奇
维护人员:迈克尔·奥尔布里奇(Michael Olbrich)<M.Olbrich-at-protonmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MBECS”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“MBECS”)
细节
生物视图 |
BatchEffect(批次效果),微生物组,规范化,质量控制,报告写作,软件,可视化 |
版本 |
1.8.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.15(R-4.2)(2.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
方法,马格里特,品学兼优,利马,lme4公司,lmer测试,情势图,rmarkdown公司,集群,dplyr公司,ggplot2,额外网格,ruv(俄罗斯),特别行政区,易怒的,三年,素食主义者,统计数据,实用程序,矩阵 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/rmolbrich/MBECS网站 |
错误报告 |
https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。