链接HD

LinkHD:探索和集成异构数据的通用框架


生物导体版本:释放(3.19)

在这里,我们提出了Link-HD,一种集成异构数据集的方法,作为STATIS-ACT(“Structuration des Tableaux a Trois Indices de la Statistique–Analyse Conjointe de Tableaux”)的推广,这是一系列连接和比较多个子空间信息的方法。然而,STATIS-ACT有一些缺点,因为它只允许连续数据,并且无法在样本和特征之间建立关系。为了解决这些限制,我们结合了多个距离选项和基于线性回归的双地块模型,以建立观测值和变量之间的关系,并进行变量选择。

作者:劳拉·辛加雷蒂

维护人员:“Laura M Zingaretti”<M.lau.Zingaretti at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“LinkHD”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“LinkHD”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“LinkHD”)
注释基因组变异 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 分类,多重比较,回归,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.6.0),方法,ggplot2,统计信息
进口 规模,集群、图形、,ggpubr公司,额外网格,素食主义者,里约,多重分析实验,emmeans公司,重塑2,数据表
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 链接HD_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 链接HD_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 链接HD_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 链接HD_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LinkHD网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/LinkHD
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/LinkHD网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/LinkHD/
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