蕾丝

癌症演变的纵向分析（LACE）

生物导体版本：释放（3.19）

LACE是一种算法框架，它处理在不同时间点和不同实验环境中收集的癌症样本中的单细胞体细胞突变谱，以产生癌症进化的纵向模型。该方法通过最大化在多个时间点上计算的加权似然函数，解决了具有系统发育约束的布尔矩阵分解问题。

作者：丹尼尔·拉马佐蒂，法布里奇奥·安加罗尼[aut]，大卫德·马斯佩罗[cre，aut]，吉安卢卡·阿斯科拉尼[aut]

维护人员：戴维德·马斯佩罗（Davide Maspero）

引文（从R中输入引文（“LACE”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“LACE”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“蕾丝”）

生物视图	生物医学信息学,单个单元格,软件,体细胞突变
版本	2.8.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年）
许可证	文件许可证
取决于	R（>=4.2.0）
进口	卷曲,记录仪,foreach公司,do并行,可分类的,数字播放器,对于猫,数据树，图形，grDevices，并行，R彩色啤酒,快速，统计，总结性实验，实用程序，呜呜声,斯特林吉,字符串,矩阵,第三年,jsonlite公司,阅读器,配置程序,DT公司、工具、，英尺,数据表,html工具,html小部件,bsplus（英国标准普尔）,闪亮验证,闪亮的,发光体,shiny文件,闪亮的牛仔裤,闪亮BS,闪亮的仪表板,生物电阻,呼叫者,记录器,ggplot2,斯格利特
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/BIMIB-DISCo/LACE网站
错误报告	https://github.com/BIMIB-DISCo/LACE网站

建议	生物遗传学,仿生风格,测试那个,针织物,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	LACE_2.8.0.tar.gz地区
Windows二进制	LACE_2.8.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	拉丁美洲-2.8.0.tgz
macOS二进制（arm64）	拉丁美洲-2.8.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LACE
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/LACE
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/LACE/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/LACE/
软件包下载报告	下载统计信息