HiCool公司

生物导体版本：释放（3.19）

HiCool提供了一个R接口来处理和规范Hi-C配对快速q读取。（m）酷文件。（m） cool是一种紧凑的索引HDF5文件格式，专门为高效存储基于HiC的数据而定制。除了处理快速读取之外，HiCool还提供了一个方便的报告功能，以生成总结Hi-C实验并包括质量控制的可共享报告。

作者：雅克·塞里扎伊[aut，cre]

维护人员：雅克·塞里扎伊

引文（从R中输入引文（“HiCool”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“HiCool”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“HiCool”）

生物视图	DNA3D结构,数据导入,HiC公司,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.2），HiCE实验
进口	生物信息组织,S4载体,基因组范围,I范围,交互集,房间,蛇怪,网状的,rmarkdown公司,rmd格式,巧妙地,数字播放器,字符串,sessioninfo（会话信息），实用程序
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/js2264/HiCool
错误报告	https://github.com/js2264/HiCool/issues网站

建议	Hi联系人,HiContactsData（HiContacts数据）,批注中心,生物文件缓存,仿生风格,测试那个,针织物,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我	OHCA公司
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	高制冷_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）	高制冷_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiCool
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/HiCool
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HiCool/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/HiCool/
软件包下载报告	下载统计信息