全球视野

scRNA-Seq数据的群体级表示


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在表示和总结样本的整个单细胞轮廓。它允许研究人员在样本级别执行重要的生物信息分析,如可视化和质量控制。主要功能估计样本分布,计算样本之间的统计差异,并通过MDS图可视化距离矩阵。

作者:威廉·托罗斯,王浩[aut],伊丽莎白·普多姆,龚伯英

维护人员:威廉·托罗斯(William Torous)在伯克利教育学院(berkeley.edu)学习

引文(从R中输入引文(“GlobScope”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“GlobScope”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GlobScope”)
全球视野 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据表示,质量控制,RNA序列,排序,单个单元格,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.4.0)
进口 utils、stats、,MASS(质量),麦克卢斯特,ggplot2,RANN公司,FNN公司,生物并行,mvn播送,单细胞实验,爱尔兰航空公司
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/epurdom/GloScope/issues网站
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建议 仿生风格,测试那个(>= 3.0.0),针织物,rmarkdown公司,zellkonverter公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 全球范围_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 GlobeScope_1.2.1.zip公司
macOS二进制(x86_64) 全局范围_1.2.1.tgz
macOS二进制(arm64) 全球范围_1.2.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GloScope公司
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/GloScope
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GloScope网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GlobScope网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档