GSgalgoR公司

识别和研究癌症预后基因表达特征的进化框架


生物导体版本:释放(3.19)

基于非支配排序遗传算法的疾病子类型发现多目标优化算法。“Galgo”框架结合了用于分组异构“组学”数据的聚类算法的优点和用于特征选择的遗传算法的搜索特性。该算法在保持簇一致性高的同时,考虑子类型之间生存差异最大化的特征,搜索最优簇数确定。

作者:马丁·格雷罗[aut],卡洛斯·卡塔尼亚[cre]

维护人员:卡洛斯·卡塔尼亚(Carlos Catania)

引文(从R中输入引文(“GSgalgoR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“GSgalgoR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GSgalgoR”)
GSgalgoR.html网站 HTML格式 R脚本
GSgalgoR_callbacks.html HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,群集,基因表达式,软件,生存,转录
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(4年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 集群,do并行,foreach公司,匹配R,nsga2R型,生存,代理,统计信息,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR
错误报告 https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR/issues网站
查看更多
建议 针织物,rmarkdown公司,ggplot2,仿生风格,日内瓦,survcomp公司,博科生物,监督员,乳腺癌移植,乳腺癌UPP,iC10培训数据,帕姆,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 GSgalgoR_1.14.0.tar.gz号
Windows二进制 GSgalgoR_1.14.0.zip公司(仅64位)
macOS二进制(x86_64) GSgalgoR_1.14.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) GSgalgoR_1.14.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSgalgoR网址
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/GSgalgoR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GSgalgoR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GSgalgoR/
软件包下载报告 下载统计信息