GGPA公司

graph-GPA：确定GWAS结果优先级和研究多效性架构的图形模型

生物导体版本：释放（3.19）

全基因组关联研究（GWAS）是一种广泛使用的工具，用于识别与表型和疾病相关的遗传变异，尽管具有许多小影响遗传变异的复杂疾病给传统的这些研究带来了困难。通过利用多效性，可以提高单个GWAS的统计能力。该软件包提供了用于拟合图形-GPA的功能，图形-GPA是一个统计框架，用于通过集成多效性对GWAS结果进行优先级排序。”GGPA包提供了用户友好的界面，以适应图形-GPA模型，实现关联映射，并生成表型图。

作者：钟东军、金汉杰、卡特·艾伦

维护人员：钟东军<gmail.com>

引文（从R中输入引文（“GGPA”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“GGPA”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignets（“GGPA”）

GGPA公司	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	分类,群集,差异表达式,基因表达式,遗传学,基因组广泛协会,多重比较,预处理,SNP公司,软件,统计方法
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=4.0.0），统计，方法，图形，GGally公司,网络,国家统计局,规模,矩阵统计
进口	卢比(>= 0.11.3)
系统要求	GNU品牌
统一资源定位地址	https://github.com/dongjunchung/GGPA网站/

建议	仿生风格
链接到	卢比,RcppArmadillo公司
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	GGPA_1.16.0.tar.gz公司
Windows二进制	GGPA_1.16.0.zip公司
macOS二进制（x86_64）	GGPA_1.16.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	GGPA_1.16.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GGPA
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/GGPA
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GGPA网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/GGPA/
软件包下载报告	下载统计信息