部门
高维实体中簇的基本表型元素的测定
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包的目的是识别数据集中可以分离群体的特征。这是在两个级别上完成的。首先,使用稀疏K-means实现进行聚类。其次,生成的聚类用于根据观察结果在不同聚类中的分布预测个体组的结果。由于将识别具有分离信息的某些簇,并且这些簇由稀疏的变量数定义,因此该方法可以降低数据的复杂性,只强调实际重要的数据。
作者:雅各布·诺尔[aut,cre],Axel Theorell[自动]
维护人员:雅各布·托雷尔(Jakob Theorell at ki.se>)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“DepecheR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“DepecheR”)
细节
生物视图 |
基于细胞的分析,分类,群集,数据表示,差异表达式,尺寸缩减,特征提取,流式细胞术,免疫肿瘤学,RNA序列,单个单元格,软件,转录,转录组学,可视化 |
版本 |
1.20.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.9(R-3.6)(5.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.0) |
进口 |
ggplot2(>= 3.1.0),质量(>= 7.3.51),卢比(>= 1.0.0),dplyr公司(>= 0.7.8),gplot公司(>= 3.0.1),翡翠色(>= 0.5.1),foreach公司(>= 1.4.4),多斯诺(>= 1.0.16),矩阵统计(>= 0.54.0),mixOmics公司(>= 6.6.1),力矩(>=0.14),grDevices(>=3.5.2),graphics(>=3.52),stats(>=3.5.2),utils(>=3.5),methods(>=3.5%),parallel(>=35.2),重塑2(>= 1.4.3),豆瓣(>= 1.2),FNN公司(>= 1.1.3),鲁棒基地(>= 0.93.5),g模型(>= 2.18.1),崩溃(>= 1.9.2),群集R(>= 1.3.2) |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。