DCATS公司

由相似矩阵变换的微分组合分析


生物导体版本:释放(3.19)

方法检测单细胞RNA-seq实验中不同条件下的差异成分丰度,有无重复。它旨在纠正错误分类带来的偏见,并能够控制混杂的协变量。为了避免大细胞类型比例变化的影响,DCATS可以使用总细胞数或特定参考群作为归一化项。

作者:林欣怡[aut,cre]、Chuen Chau[aut]、Yuanhua Huang[aut].、Joshua W.K.Ho[aut]

维护人员:林欣怡<linxy29 at connect.hku.hk>

引文(从R中输入引文(“DCATS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“DCATS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“DCATS”)
利用DCATS进行差异成分分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 规范化,单个单元格,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.1.0),统计
进口 MCMC组件,矩阵统计,鲁棒基地,声光器件,e1071号
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 DCATS_1.2.0.tar.gz公司
Windows二进制 DCATS_1.2.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) DCATS_1.2.0.tgz文件
macOS二进制(arm64) DCATS_1.2.0.tgz文件
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DCATS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/DCATS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DCATS/
包短Url https://bioconductor.org/packages/DCATS/
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