群集折叠相似性

使用foldchange计算不同单细胞样本的聚类相似性

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包使用不同样本/批次/数据集簇之间共享特征（例如基因）的折叠变化来计算相似系数。使用样本/数据集n的源簇i和样本/数据集中m的所有目标簇j之间的每一对Fold Changes组合的点积（Hadamard乘积）计算相似系数

作者：奥斯卡·冈萨雷斯-韦拉斯科[cre，aut]

维护人员：奥斯卡·冈萨雷斯-韦拉斯科（Oscar Gonzalez-Velasco）

引文（从R中输入引文（“ClusterFoldSimilarity”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“ClusterFoldSimilarity”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“ClusterFoldSimilarity”）

生物视图	群集,特征提取,基因靶点,图形和网络,RNA序列,单个单元格,软件
版本	1.0.0
在生物导体中	生物C 3.19（R-4.4）（<6个月）
许可证	艺术-2.0
取决于
进口	方法，记录仪,ggplot2,规模,生物并行，图形，统计，实用程序，矩阵,奶牛场,dplyr公司,重塑2,修拉,修饰符对象,单细胞实验,ggdendro公司
系统要求
统一资源定位地址

建议	针织物,rmarkdown公司,kableExtra（额外）,单链核糖核酸酶,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	群集折叠相似性_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	ClusterFoldSimilarity_1.0.0.zip
macOS二进制（x86_64）	群集折叠相似性_1.0.0.tgz
macOS二进制（arm64）	簇折叠相似性_1.0.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterFoldSimilarity网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/ClusterFoldSimilarity
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ClusterFoldSimilarity网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/ClusterFoldSimilarity网站/
软件包下载报告	下载统计信息